คณะวิทยาศาสตร์ ได้ให้ความร่วมมือดำเนินงานตามโครงการ พสวท. ซึ่งเป็นโครงการที่เกิดจากความร่วมมือของ 4 หน่วยงาน ประกอบด้วย กระทรวงวิทยาศาสตร์เทคโนโลยีและสิ่งแวดล้อม กระทรวงศึกษาธิการ ทบวงมหาวิทยาลัย และสถาบันส่งเสริมการสอนวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มีจุดมุ่งหมายร่วมกันส่งเสริมและผลิตบัณฑิตที่มีคุณภาพทางด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี โดยเฉพาะวิทยาศาสตร์พื้นฐานในสาขาที่ขาดแคลนเพื่อสนองความต้องการของประเทศอย่างเร่งด่วน โดยรับผิดชอบเป็นศูนย์ของโครงการ พสวท. ระดับอุดมศึกษาประจำภาคเหนือ ซึ่งรับผิดชอบคัดเลือกนักเรียนจากโรงเรียนมัธยมศึกษาใน 17 จังหวัดเขตพัฒนาภาคเหนือ ประกอบด้วยจังหวัดกำแพงเพชร เชียงราย เชียงใหม่ ตาก นครสวรรค์ น่าน พะเยา พิจิตร พิษณุโลก เพชรบูรณ์ แพร่ แม่ฮ่องสอน ลำปาง ลำพูน สุโขทัย อุตรดิตถ์ และอุทัยธานี ที่มีผลการเรียนดีและสนใจทางด้านวิทยาศาสตร์เป็นพิเศษเข้าศึกษาในคณะวิทยาศาสตร์ สาขาวิชาเอกคณิตศาสตร์ เคมี ชีววิทยา ฟิสิกส์ และธรณีวิทยา

คณะวิทยาศาสตร์ ได้ริเริ่มโครงการรับนักศึกษาเข้าโดยวิธีพิเศษ (วพ.) ขึ้นอีกโครงการหนึ่งเพื่อตอบสนองนักเรียนที่พลาดโอกาสในโครงการ พสวท. และมีความตั้งใจแน่วแน่ที่จะเข้าศึกษาในคณะวิทยาศาสตร์ โครงการ วพ. ได้กำหนดรับนักศึกษาพร้อม ๆ กันกับการรับนักศึกษาเข้าโครงการ พสวท. ตั้งแต่ปีการศึกษา 2528 เป็นต้นมา ในระยะแรก (ปีการศึกษา 2528-2535) กำหนดรับนักศึกษาทั้งสองโครงการ จำนวนไม่เกิน 50 คน ต่อมาในระยะที่สอง (ปีการศึกษา 2536-2539) กำหนดรับนักศึกษาทั้งสองโครงการจำนวนไม่เกิน 100 คน และระยะที่สาม( ตั้งแต่ปีการศึกษา 2540 เป็นต้นมา) กำหนดรับนักศึกษาโครงการพิเศษรวมทุกโครงการจำนวนไม่เกิน 125 คน

ตามที่ทบวงมหาวิทยาลัยมีแผนการรับนักศึกษาสาขาวิชาคณิตศสตร์และสาขาวิชาคณิตศาสตร์ศึกษาโดยจัดสรรทุนการศึกษา
สาขาวิชาคณิตศาสตร์ให้กับมหาวิทยาลัย 16 แห่ง ๆ ละ 5 ทุน นั้น คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ได้ให้ความร่วมมือกับทบวงมหาวิทยาลัยในการรับนักศึกษาเข้าศึกษาในโครงการ รพค. ดังกล่าวนี้ โดยเห็นชอบให้การดำเนินการอยู่ภายใต้การดูแลของคณะทำงานโครงการ พสวท. และ วพ. ในปีการศึกษา 2538 การรับนักศึกษาได้คัดเลือกจากนักศึกษาชั้นปีที่ 1 โดยการประกาศรับสมัครนักศึกษาที่มีเงื่อนไขครบตามคุณสมบัติและมีความสนใจที่จะศึกษาในสาขาวิชาคณิตศาสตร์ สำหรับปีการศึกษา 2539 เป็นต้นมา การรับนักศึกษาจะคัดเลือกโดยใช้กระบวนการและข้อสอบเดียวกันกับการสอบคัดเลือกนักศึกษาในโครงการพิเศษอื่น ๆ

ทบวงมหาวิทยาลัย กระทรวงศึกษาธิการ และสถาบันส่งเสริมการสอนวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี ได้ร่วมกันจัดทำโครงการส่งเสริมการผลิตครูที่มีความสามารถพิเศษทางวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์(สควค.) ขึ้นเพื่อผลิตครูวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ที่มีความสามารถมีคุณภาพสูง และเป็นส่วนหนึ่งของการแก้ปัญหาการขาดแคลนครูวิทยาศาสตร์ และคณิตศาสตร์ โดยหาวิธีการจูงใจให้ผู้ที่มีความรู้ ความสามารถสูงทางวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์สนใจมาเรียนเป็นครูวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ ให้มากขึ้น อาทิเช่น การให้ทุนการศึกษา การบรรจุเข้ารับราชการทันทีที่จบการศึกษา และมีเงินเพิ่มค่าวิชาชีพที่ขาดแคลน รวมทั้งให้สวัสดิการต่าง ๆ เพื่อให้อาชีพครูมีเกียรติและมีศักดิ์ศรี โดยคาดหวังว่าครูที่เป็นผลผลิตของโครงการนี้จะกระจายไปอยู่ทั่วประเทศเป็นครูตัวอย่างที่จะทำให้มีผู้ใฝ่ใจเรียนเป็นครูวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์เพิ่มมากขึ้น และเป็นกำลังสำคัญในการแก้ปัญหาการเรียนการสอน และการพัฒนาทางด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีต่อไป ทั้งนี้ คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ได้เข้าร่วมโครงการเพื่อผลิตครูวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ สำหรับโรงเรียนมัธยมศึกษาในภาคเหนือระยะที่ 1 ตั้งแต่ พ.ศ. 2539-2545

มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ได้มีนโยบายรับนักเรียนที่มีผลการเรียนดีในระดับมัธยมศึกษาตอนปลายเข้าศึกษาในสาขาวิชาที่สนใจตามคณะต่าง ๆ จึงได้กำหนดโครงการรับนักเรียนที่มีผลการเรียนดีเข้าศึกษาขึ้น โดยเริ่มตั้งแต่ปีการศึกษา 2541 เป็นต้นไป ในส่วนของคณะวิทยาศาสตร์ ได้ดำเนินการรับสมัครและสอบคัดเลือกนักเรียนชั้น ม.6 ในเขตพัฒนาภาคเหนือ เข้าศึกษาในโครงการรับนักเรียนที่มีผลการเรียนดี จำนวนปีละไม่เกิน 20 คน ตั้งแต่ปีการศึกษา 2541 เป็นต้นไป โดยทำการสอบคัดเลือกพร้อมกับการสอบคัดเลือกนักเรียนเข้าศึกษาในโครงการ พสวท. สควค. รพค. และ วพ. มีวัตถุประสงค์เพื่อคัดเลือกและให้การสนับสนุนนักเรียนที่มีผลการเรียนดี ในระดับมัธยมศึกษาตอนปลายเข้าศึกษาในสาขาวิชาที่สนใจ และมีความถนัดในคณะวิทยาศาสตร์ เพื่อเตรียมบัณฑิตที่มีคุณภาพสูงสำหรับศึกษาต่อในระดับบัณฑิตศึกษาเป็นนักวิจัยหรือเป็นอาจารย์ของมหาวิทยาลัย

สำหรับปีการศึกษา 2542 คณะวิทยาศาสตร์ ได้คัดเลือกนักเรียนเข้าเรียนในโครงการ พสวท. 20 คน รพค. 5 คน สควค. 17 คน และโครงการรับนักเรียนที่มีผลการเรียนดี 17 คน รวมนักศึกษาโครงการพิเศษทุกโครงการทั้งสิ้น 59 คน